Wystawa główna Muzeum będzie zajmowała powierzchnię niemal 7 tysięcy m2, co uczyni ją jedną z największych wystaw prezentowanych przez muzea historyczne na świecie. Muzeum stanie przy ulicy Wałowej, blisko Głównego Miasta.
W nowoczesny sposób ma ona prezentować II wojnę światową zarówno z perspektywy ówczesnej wielkiej polityki i przede wszystkim — przeżyć zwykłych ludzi. Ekspozycja ma przedstawiać nie tylko losy Polaków, ale też doświadczenia innych narodów. Wystawę będą tworzyły trzy bloki narracyjne: Droga do wojny, Groza wojny oraz Długi cień wojny.
Film prezentujący wystawę stałą Muzeum II Wojny Światowej:
Wystawę główną projektuje belgijska pracownia Tempora, która została wyłoniona w międzynarodowym konkursie na projekt ekspozycji Muzeum II Wojny Światowej w 2009 r. Szczególnie istotne w tym projekcie jest odejście od koncepcji ekspozycji planszowej w stronę zróżnicowanej ekspozycji przestrzennej.
Muzeum ma zostać otwarte w maju 2015 roku. Inwestycja ma pochłonąć ponad 350 mln zł.